Sa victoire à Bir-Hakeim, contre l’Afrika Korps de Rommel, fait entrer Pierre Kœnig dans la légende en 1942.
A l’issue de cette bataille héroïque, il aurait ordonné à des soldats juifs de l’armée britannique de garder déployé leur fanion orné de l’Etoile de David, et à ses propres hommes de saluer cet emblème alors interdit dans l’armée de Sa Majesté. Cet épisode dit « du drapeau de Sion » préfigure l’engagement du général Kœnig en faveur de l’Etat d’Israël.